1996年1月，蘇州市郊、吳縣市信用聯(lián)社分別與市郊農(nóng)行、吳縣市農(nóng)行脫離行政隸屬關系，獨立對外營業(yè)。1999年9月，實行統(tǒng)一法人，由單個法人信用社合并為以縣聯(lián)社為單位的統(tǒng)一法人。2001年3月，隨著吳縣市撤市建區(qū)，吳縣市農(nóng)村信用合作聯(lián)社轄區(qū)相應變?yōu)樘K州市吳中、相城兩區(qū)。蘇州市郊農(nóng)村信用合作聯(lián)社轄區(qū)主要是現(xiàn)蘇州市工業(yè)園區(qū)和高新區(qū)兩區(qū)。

2002年12月18日，蘇州市郊農(nóng)村信用聯(lián)社與吳縣市農(nóng)村信用聯(lián)社合并重組正式成立蘇州市區(qū)農(nóng)村信用合作聯(lián)社，下轄吳中區(qū)、相城區(qū)、高新區(qū)、工業(yè)園區(qū)四個區(qū)信用社，機構網(wǎng)點遍布蘇州市區(qū)城鄉(xiāng)。

經(jīng)中國銀行業(yè)監(jiān)督管理委員會批準，蘇州市區(qū)農(nóng)村信用合作聯(lián)社組建為江蘇東吳農(nóng)村商業(yè)銀行股份有限公司，并于2004年12月28日正式對外掛牌開業(yè)，成為全國第5家股份制農(nóng)村商業(yè)銀行。

2010年9月28日，經(jīng)中國銀監(jiān)會批準，江蘇東吳農(nóng)村商業(yè)銀行正式更名為蘇州銀行股份有限公司，開辟了我行發(fā)展歷史的新篇章。

2011年3月17日，經(jīng)中國銀監(jiān)會銀監(jiān)復〔2011〕82號文件批準，蘇州銀行股份有限公司監(jiān)管隸屬關系由農(nóng)村中小金融機構監(jiān)管序列調(diào)整為中小商業(yè)銀行監(jiān)管序列，標志我行的行業(yè)性質(zhì)正式由農(nóng)村商業(yè)銀行轉(zhuǎn)變?yōu)槌鞘猩虡I(yè)銀行。